Wenn ein CNC-System aktiviert wird, werden die gewünschten Schnitte in die Software programmiert und den entsprechenden Werkzeugen und Maschinen vorgegeben, die die vorgegebenen Maßaufgaben ausführen, ähnlich wie ein Roboter.

Bei der CNC-Programmierung geht der Codegenerator innerhalb des numerischen Systems häufig davon aus, dass die Mechanismen fehlerfrei sind, obwohl Fehler möglich sind, die größer sind, wenn eine CNC-Maschine angewiesen wird, gleichzeitig in mehr als eine Richtung zu schneiden.Die Platzierung eines Werkzeugs in einem numerischen Steuerungssystem wird durch eine Reihe von Eingaben beschrieben, die als Teileprogramm bezeichnet werden.

Bei einer numerisch gesteuerten Maschine werden Programme über Lochkarten eingegeben.Im Gegensatz dazu werden die Programme für CNC-Maschinen über kleine Tastaturen in Computer eingegeben.Die CNC-Programmierung bleibt im Speicher eines Computers erhalten.Der Code selbst wird von Programmierern geschrieben und bearbeitet.Daher bieten CNC-Systeme eine weitaus größere Rechenkapazität.Das Beste daran ist, dass CNC-Systeme keineswegs statisch sind, da neuere Eingabeaufforderungen durch überarbeiteten Code zu bereits vorhandenen Programmen hinzugefügt werden können.